自媒体运营模式简单，人人都可以发表自己看法，有利于民意采集和由于自媒体平台门槛低，在运营过程中常常出现一边倒的现象。大众对于信息缺乏辨识力，在未经过专业部门的审查后，自媒体工作者直接将不实信息发表，对于网络环境造成了极大的污染，同时，大众的盲目传播以及肆意攻击都会产生难以想象的危害。其次，管理者在文化素质，知识储备上方面不如传统媒体可信，同时，来自媒体的运营团队大多在个人或小团队中，没有专门的信息采集和信息来源，因此，媒体在向大众传递信息时往往缺乏公正的观点公信力的缺失影响了自媒体的未来发展，也制约了自媒体承担社会责任。
自媒体平台的出现，体现了媒介资源的转移，但常常出现假信息，标题党，夸大信息，商业软文新闻化，老闻变假闻，观点与新闻信息混杂等问题，体现出我国在自媒体审查方面的薄弱。另一方面，自媒体平台运营过程中，由于侵权成本低，许多不法分子肆意侵犯作者权益，在未经允许的前提下将作者文章进行照搬照抄，或者将他人作品修改后加以发表，都严重侵犯了他人著作权。其次，自媒体运营时自律不够并且缺少他律，常常出现注水现象。为了使自媒体平台扩大，运营者选择了购买僵尸粉，导致许多平台徒有其表，水分过大，严重影响了读者的阅读体验，甚至传达了错误的价值观。
我国自媒体平台上处于起步阶段，发展并不成熟，生产，经营，盈利模式都比较单一，在这种背景下，公关和广告商往往瞄准自媒体平台内容，大肆传播，达到商业目的，目前，软文和广告是平台盈利的主要手段，而为了增加文章阅读量，制造噱头，经营者们也是不惜雇佣大量水军提高平台流量，但过多经营软文却在一定程度上牺牲了平台的文化价值，这一代价相对于经营软文获得的收入一时无法观测，但从长期来看，却导致了平台潜在价值丧失，沦为商业武器。博主们为了平台效益，常常会选择将平台作为商业公关或广告的发布手段，对于大众而言，不仅限制了信息的来源途径，而且信息的真实性，客观性也难以得到保障。
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